+Marker Data: gg6873_1024

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_12
Marker Type SNP
Map Position 0.736
Annotation
Source Name FKO03-01.7064.C1
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c6873
454-Contig_seq (unpadded) TTTATATTAGTATAACGTGTAATGATGCTTGCTGGATTTATTCACTTGCGAGATTTCGCACTCAGTTGTTGCTGTAGTAGTTTNTCGGAATTTAGGACATTGGTGTGTCTTGGATTGAACTTGTGTGAAATCTAATTGTTAATTGCGTGGGATATTTCATAATTGACTTCCATGAACCTAGTAGTTTGATAATTTGGGCGAAGGGCAAAGCGCTGGTGGTATATTCATGCATCAGGTAGTACCCATGCGGTAATTTAGGCCTTAGGTGTTAGATGTTGCAATTAAAGAAGTAATGAATTTGGGTTGTCTTGAGTGTTCCNAATCTAATTAAAGTAGGTGAATCCGCCAGGAGTTTAGGTTTTACTGCTCACTTGCTAATAATATTTGGTGGCTTTTCCTTTTTCTGCACAGGNGTTACCAAAGGAGTAAGAGATTTACCAGGAAGCTTCCACTCCGCAACCAGCAGTGTCCCTTCTGGGAAGTCCCTTATGTACTTTGGCTTATTTCTTGTAGCTGGTGTTTTCTTCATCTTCATNTGCATTCACTATGTTCCTCCCTGTAATGGTGCTGATGCCTCAGAAATTTGCTATCTGCTTCACAATTGGTTGTGCATTCATTATTGGCTCGTTCTTTGCCCTCAAAGGTCCAAAGAATCAGCTTACACACATGACATCAAAGGAGGTACTTAATCATCCTCAGTCTTGGTTTGCCATCTTTTATGTCTAACTTGTTGGTTTGNTCAAAATAGATAAAAGCACCTTTCTCTTCCATTGTGATAGCTCAATTTTCTGCAATCTCATTATTCTTCTTTCGTCTCCAGAGACTTCCTTTTACAGCGGTTTTTATTGGCAGCATGGTAGGGACCATTTATGTCTCTATGGTGCTTCACAGTTATATCCTTTCTGTGCTCTTCTCAGTGATACAGGTATTGGATTACTGGCCGCTTTTTCCTTCGTTTTAACACCCATGCTACTTTTATTTTGCTAATAATTTGGCCATGATAAATTCTTCTGTTAGTCTCTATTGATTGGAAATGCGACAAACACTTTAAAGTTTGCTAGTTGATATTCCAGGGCACATAGCCCGGAAAAATAAAATGGTTCTTGGACAAATAATATGCTACTATGAGCTTTCCAACTTATCAAAAGTT
SNP_position 1024
sequence_for_GGdesign CCATGCTACTTTTATTTTGCTAATAATTTGGCCATGATAAATTCTTCTGTTAGTCTCTAT[A/T]GATTGGAAATGCGACAAACACTTTAAAGTTTGCTAGTTGATATTCCAGGGCACATAGCCC
GGdesign_Final_Score 0.848
Ilmn_Id 6873_1024-0_B_R_1967852540
allele_1 A
allele_2 T

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_12 0.736

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain