+Marker Data: SOL2110

Crop eggplant
Population LW2010
Linkage Group E_01
Marker Type SNP
Map Position 115.4
Annotation
Source Name SmFL34E02A
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd ATTGAGCCTTCTCTGATGGCTTTG
STS_primer_rev CTGGTTGCTGTGCCCACATTT
amplicon_seq AACACCAGGAGAGTGATTTGCCGCAAGTAAGTTTTTTCTTTCCTTTCTACTTTTGCAACTGCATTTCGTTTTGTATGAAATAATTCTAAGATCCACTACGGTCCGTGCATTGCTGTATGGTAGTGATATTGATGTATGGTCTTGCTCTTCGTATTGAATTGGCTGTTATTCATCATTAAAAATGTTGTTGCATAGCTAATTCATACCTCCGATCACGCTATTTAAAATTCATACAAGTTAATCTGAGTTGTGCTACAACTATATGTTGCAGCCTCTAGTAAGAATACACTTACAGTGGTGCAAAATATGAGTCATTAACTAAATGGTATTGTCTGAGAAGTTATTTCCATGAATACAGGTTTGCATGCGACGTCCATTGCATGTAATTACAGGAAAGGCGTACAACAAATTATGCTTTTCAAAATTATAAACAAAACATAAACATGAAGGTGCAAAATACATGCACTTTCAACCTTAGAGAATTAGTCTGAACTGGTCACTTTGAGGAAATCGGATTCCCAGTTGTTTGTCAGTTAAGTGTTTTGCTTGTATGGGAGTGATGTTCTAGTTAAAAAAAGGTCATAATGATAGAGAATTTAAGGATGAGAAAATAACTGACCTAGAAGTTTACTTCTTGAGACTTATTGACTGGTTAGGTAGCTCATGCTTATTTATTATTTGTATCCTTGCAGTAACTATACATCCATGATCTGTATAAGTTTTAAATGTTAGTCTGTGGGATTTGAGTTCTGTGGGATTTAATAGACGGTTGATTATAGACAGCATGTGTTAGTGTATTTGTCTTTCTATCGGAGCATAGAAATTTCTACTTTTGGTTTTTATGTTGATTTCTTTAGAGTATAATTACAACATCCCTTGACCTGCATCAACAGCTTTGAGTATAATAACACTTAAAAGGATTAACATTTACAACATCCTTTGACCTACATCATCAGTTTTGTACTCCCTTCAGCCAATAGCTTTTTGAAATAGTGTGGACAGTTAACTTCTCTTGAAAAGAATTCTTCTCAGGATTTTCGATGAGTAACTATTTCACCAAATGGTGCCATCCAAAAAATCGTTGTGTGGATGACTATTGTGCATTTCTTTTTATATCTATTAGCAGGGTAAGGTATAACCTTGTGCGGCCTGCATACTTGTGAGGCTAAAATTTCTTTTTGCCTTCTCTGACTTTTGACTGTTCACGTTACAGCGTCTAAAACCTTGGTTGTGACTGCTTAATCCTGATACCTGTTTACTTGTTTTAGGTGTTATGCTCGCCTGCTCCTCCGTGCTGAAG
SNP_position 522
allele_1 G
allele_2 A
ASP_primer_S GCGGGCCACTTTGAGGAAATCGGATTCCCAA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCCACTTTGAGGAAATCGGATTCCCAG
Common_primer ACATCACTCCCATACAAGCAAAACA
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen

Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 G G
WCGR112-8 A A

Population Linkage Group Position
LW2010 E_01 115.4
LWA2010 LWA_01 94.607
LWAE2012 E_01 96.269
LWF2_2022 E_01 70.0

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain