Typing_Method |
Tm-Shift
|
Marker_Class |
SOL
|
STS_primer_fwd |
ACGAGCTTTGGGTATGTCTATGCG
|
STS_primer_rev |
TTCTTCCTCTTCCTGCTGCTGTTT
|
amplicon_seq |
TGGTCTCTCTAGAGCAGGTGGGCTGATATAATGTATTGGCATGGAAGTATTGCTTTTATTCTGTATTGCTAAGTAACAATGTCATTCACTAGGAATATATGATATATTGAAAATTAGTTGAACTTCAGATCCTAATATAACCGGGGAAAGAAAAAGCGAGAGAGGGATACGTGTTTTCAAGTTTATAAATTTTCTTAGGGAAAGAAAGGATGAGATTGCCCCATGAAGCAATAAAACTGTTCATGCCTTTGAAAAAATTGTGAGTCTGCAACTTCTTTTTTTTTTTTTGAAAAGGAAAAAAACTTGAAAGTCGGCAGGGTATTCGGGATTTAACTTTTGTCTTCCCGAAAAAAAAGGTTGTAAAAGGGTTTTGGACACCCAAATAATTTGGGCCAGGGAAGGGGTTCTCTGGCACAAAATTAAGGATCTTTGTTGCAGGCTTATTCTTTCTTTTTAGGTGGTTCCCCTTTCCCAGCATTCCAAAATACCTGTAGATTGTCCTGTGTTTATTCTTGGGGGAGTTAACTCTTTTGTCATTTGGGGAAGTTGACCTACAACATCAGTAACTATTTATGGCAAGCCTGAATATGGTAACATGGAAATAAATGACATGTTATAGCTGGTTAAAACATTGATAGTTTTAAAAATTATTCATTCAGTAATATCAGTAAGTTAAACCCCTAAATAGAGCGTGTGGAAAGTATGAAGTGTTTGATTAAAGTTGAAATTTGTTTGGAAGATGTCAATATCACAGAAGGACTTGACAGTCTTGTGTGGTTAGTTAATTTTATACCTGAGATATCCATTCCTTCGGTGAATACAACTAATTTCTGAAGTACTTGATTCAAAAGAAACAACTACTTATTTCAGGAAAAAGTTGCACATTGGTTGTGCTACAAGTGCGCACAGTGAAAGATTCAGAATATCCTTGCTTAATATTTTAGACTCTAGATGATAAACATATCTGGCTGAATTTCATTGTCAACTCCAGTTCTTTTCCGTCAATAATTTCAATTCTTGATTCTCAGGTCCAACAACGATTTGAGTCACTCAAGAAGCGCAAGGATCCAGGAAGCTTTACTGTGCAAGGTAGAAATCTAACCTTAAAAAAAAGGAAGAGAAATTGATAATCAGTGTCAGCTTAGTGAATGGTTCATGCTTCCATAGGTCAAGTATGTACCTTATATGTAGCAATAGCAAAGATTGATGTGGTTTTCCTTTTTCCTCTGCATCAGATTTCAGTTTGTCATTGATTAAAAAGAAAAATTCAATGTCTGCTTTCTTAGGTAAAAGGACAGGATGTACATATTGAACTGCTATGACCATCTTCATTCGTTGTAGATTTTGATGG
|
SNP_position |
236
|
allele_1 |
A
|
allele_2 |
G
|
ASP_primer_S |
GCGGGCCACAATTTTTTCAAAGGCATGAACAGT
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCCACAATTTTTTCAAAGGCATGAACAGC
|
Common_primer |
TTAGGGAAAGAAAGGATGAGATTGCCC
|
enzyme |
Native Taq
|
dye |
SYBR Green I
|