+Marker Data: tbm1380

Crop tomato
Population GM_RIL
Linkage Group GMRIL_06
Marker Type SSR
Map Position 41.4
Annotation
Source Name C06HBa0026E06
Source Type genomic
Source Sequence TCTCTTTTTTTTTTGGGAGTTCCTTTTTTGTCTCTGAAAA ATAGTAGCCAAAAAAGAGCTTTACCATCCTAAAATATAAA AGGAAAAAAAAAATGAACAAATCATCCTTACTTGGTAAAA ATTAAGTTATATAGTACTTTTTTTTTATAAATATATATAA ATTTGAATAGTAGTATAGCTCTTACTTGGATATTCTGTTG GATGCTCCTTGCATATTTTTGGTTTGTTTTGAACTTTTAA AATTATACGATTTGAATTAGATTGTGCATAAGTTATTTTG ATTTATTTTTTACGTCTATCAATTTGATTTATCAATTTTC AATTTATAAACATGTTAAATCGTTATGAAACTATTAAAAT TTTAACTTATTAAATATTGATTGCTATTGAATTAACTATT AAAATTAGTAAAAAAAGATAACTAAAAAAACTTTGAAACA AAGGTGACAAGCCATGATATTTTATTGGATGATATTTTTC CACACTTAGCACCAAATATCTATATATATATATATATATA TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA TAAAAGTTCTTGCATGGTATGAACCGTAGAATAGTGAAAT ATTAATATTTAATTGATGAAAAACGTGTGATAATGATTAT AATATAATATTTAAGTCCTAATGGTTAAATGATGGCAAAG TGTGTCATTTGTAATTAGATAATGACATAAAAATGGCTAC TATTTATAATTAATCATGTTATTTCGATATTAAATATCAT AGTAATTAAATAAATTGTATCATAGTGTGTTCACGTTTTT CATTAATAAAATCATCAAATACAATGTTTTGAAGTAATAA TTGGACTTACGAACAATAATAACCACATAATAAGTCAATG AACATTTCTATGATAGAAAATATATCTTTTATGATGGTAT TTTTATCATAAAAAATTAAAAGTTAGTACAATTAATTTCA CTTGAAGGTTGCATTCCTTAATTAACTTTTAATTCTTTCA TTAAAAACTTATTTAACTCCCTAAATTAAAATAACAAATG TCAAATGATTAATTTAAATTACC
Developer NARO
Document
motif (TA)31
PCR product (bp) 152
fwd postlabel primer tbm1380/U
fwd postlabel primer seq ACAAAGGTGACAAGCCATGATA
rev postlabel primer tbm1380/L
rev postlabel primer seq GTTTACGGTTCATACCATGCAAGA
fluor. primer
dye
fluor. Primer seq.
PCR condition 94C_3min->(94C_30s->65C_60s,-1C/cyc->72C_60s)x10->(94C_30s->55C_60s->72C_60s)x30->75C_5min->10C
polymerase Roche Taq
BIN C06_05
probe Marker TGS2372
Line allele-1 allele-2
Geronimo 154 156
Momotaro 8 120 152
Population Linkage Group Position
GMF2 GMF2_06 35.667
GM_RIL GMRIL_06 41.4
GM_RIL_4K T06 45.167
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain