Typing_Method |
GoldenGate
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454-Contig_ID |
eggplant_rep_c10422
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454-Contig_seq (unpadded) |
AAACTTCGTTGTGATCACCACCTTTGTTCATAGTCTCATGTATCTCAAAAATATTTTTAAAGACTTATACATATAGATATAATTATTCATTAAGATCTAGATATATATATAATCTTTGTGGATTTTTATTNNNAGTCTCTTTAATTTTANNNNNNNNNGGATTTTGAAGTTTAGAGAAAGATGGCTCCAGATCTATCAACAATTCTTCCTAGGGTTCTTATTGTTTCTAGAAGAACTGTTNCGNAAAAATAAATTTGTTGATTTTGTTGGTAAGTATTCGATTCGTCNTATTTTTGNTTTAATTTTCTCTTNAAAAATTTNATCGTTANNATTCTNTGANTGTNCTTTTTTTCATAAATAAANAGTGTAACATGACTGAATCCACCTGAGGTTCGTGTCGGTGGAGGAAATGGATTTGAGATAAAAGAGGGATTTTTGTCGTAAGATGTTTTATAAATAAATAAATGATTTAATTATGATATCTTTGAAAATTTGTCACGTCCATGGTTACATTAATTCTTGTGATGTTCCTCTTTTGTTATGGTAAAAAANACATTTTTATGTTTNTGTTTGCTTAAAATTCTAGTGAATATACACTTTTTGACAATTGANTTTATGTGTAATCATAATCTTGTTTTTGNATGATTAGTTTAAGTTGTTGAATTNGTGTGCTCGATTAATTTGAATACATATAAAAAGGAAGAAGTAACATACTTATTTTACNTTTTTGTGCGTATTTTTATTTACTTAATTNATATGTTCGTCTGTGTAGGTGAGTATCACCTAGATCTTATTGTNGAGTTATGGAGCAGCGCCNTGTTATAGTGCCGCGAGTTAGTGGTGTACACATGTTNACTAGAAAGCTTTCAACCAATTCATGGAGTTCTTCTATGTGAAGGAGAAGACATTGATCCATCACTTTATGATGGTGAATTATGTGGATTATCACAAGAAGAACTTGAAGAAATCAAGAAATTACATTCAAGTGACACAACAATTGATAGAGAAAAAGATTCAATTGAATTAGCTCTTGCAAGACTTTGTCTTGAGAGAAATATACCTTATTTGGGAATTTGTAGAGGTTCACAAGTCCTTAATGTTGCTTGTGGTGGCACACTTTATCAAGATTTAGAGAAAGAATTGTACAAGAATCATCAAACCTCCGACTCTTCAGAAATGTTGTCATTGAAGAGCCAAAGCCAGAGTCAGAGTCAGAATCTCAGTGACATAGGTNCAAAAGTATGAANAAAGTTGTACACATGAACTATNGAAAACTATGATGGACATAGACATGTGGTGAAAGTAGTTNAAAAATACACCATTATACAAATGGTTTAAGGATTCATTAGAAGATAATGATGATGAAATTTGGGTTAACAGTTATCATCATCAAGGAGTTAAGAGATTAGCACAAAGATTTGTGCCAATGGCATTTGCTAATGATGGATTAGTTGAAGGTTTTTATGATCCAGATGCATATAATCCTGAAGAAGGTAAATTTATTATGGGATTACAATTTCATCCTGAACGTATGCGTGGACAAGATAATGGTGATTTTGATTATCCAGGATGTGCTATGGCTTACCAGGTAATTAATTAACTTGCTAATTTGTTTTATCCAGTTCAGAGTTCGAGTCCTAGGAATGAAGGA
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SNP_position |
1144
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sequence_for_GGdesign |
CACAAGTCCTTAATGTTGCTTGTGGTGGCACACTTTATCAAGATTTAGAGAAAGAATTGT[A/C]CAAGAATCATCAAACCTCCGACNCTTNAGAAATGTTGTCATTGAAGAGCCAAAGCCAGAG
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GGdesign_Final_Score |
0.846
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Ilmn_Id |
10422_1144-0_B_R_1967851279
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allele_1 |
A
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allele_2 |
C
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