+Marker Data: gg10422_1144

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_10
Marker Type SNP
Map Position 8.635
Annotation
Source Name FKO03-01.8848.C2
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c10422
454-Contig_seq (unpadded) AAACTTCGTTGTGATCACCACCTTTGTTCATAGTCTCATGTATCTCAAAAATATTTTTAAAGACTTATACATATAGATATAATTATTCATTAAGATCTAGATATATATATAATCTTTGTGGATTTTTATTNNNAGTCTCTTTAATTTTANNNNNNNNNGGATTTTGAAGTTTAGAGAAAGATGGCTCCAGATCTATCAACAATTCTTCCTAGGGTTCTTATTGTTTCTAGAAGAACTGTTNCGNAAAAATAAATTTGTTGATTTTGTTGGTAAGTATTCGATTCGTCNTATTTTTGNTTTAATTTTCTCTTNAAAAATTTNATCGTTANNATTCTNTGANTGTNCTTTTTTTCATAAATAAANAGTGTAACATGACTGAATCCACCTGAGGTTCGTGTCGGTGGAGGAAATGGATTTGAGATAAAAGAGGGATTTTTGTCGTAAGATGTTTTATAAATAAATAAATGATTTAATTATGATATCTTTGAAAATTTGTCACGTCCATGGTTACATTAATTCTTGTGATGTTCCTCTTTTGTTATGGTAAAAAANACATTTTTATGTTTNTGTTTGCTTAAAATTCTAGTGAATATACACTTTTTGACAATTGANTTTATGTGTAATCATAATCTTGTTTTTGNATGATTAGTTTAAGTTGTTGAATTNGTGTGCTCGATTAATTTGAATACATATAAAAAGGAAGAAGTAACATACTTATTTTACNTTTTTGTGCGTATTTTTATTTACTTAATTNATATGTTCGTCTGTGTAGGTGAGTATCACCTAGATCTTATTGTNGAGTTATGGAGCAGCGCCNTGTTATAGTGCCGCGAGTTAGTGGTGTACACATGTTNACTAGAAAGCTTTCAACCAATTCATGGAGTTCTTCTATGTGAAGGAGAAGACATTGATCCATCACTTTATGATGGTGAATTATGTGGATTATCACAAGAAGAACTTGAAGAAATCAAGAAATTACATTCAAGTGACACAACAATTGATAGAGAAAAAGATTCAATTGAATTAGCTCTTGCAAGACTTTGTCTTGAGAGAAATATACCTTATTTGGGAATTTGTAGAGGTTCACAAGTCCTTAATGTTGCTTGTGGTGGCACACTTTATCAAGATTTAGAGAAAGAATTGTACAAGAATCATCAAACCTCCGACTCTTCAGAAATGTTGTCATTGAAGAGCCAAAGCCAGAGTCAGAGTCAGAATCTCAGTGACATAGGTNCAAAAGTATGAANAAAGTTGTACACATGAACTATNGAAAACTATGATGGACATAGACATGTGGTGAAAGTAGTTNAAAAATACACCATTATACAAATGGTTTAAGGATTCATTAGAAGATAATGATGATGAAATTTGGGTTAACAGTTATCATCATCAAGGAGTTAAGAGATTAGCACAAAGATTTGTGCCAATGGCATTTGCTAATGATGGATTAGTTGAAGGTTTTTATGATCCAGATGCATATAATCCTGAAGAAGGTAAATTTATTATGGGATTACAATTTCATCCTGAACGTATGCGTGGACAAGATAATGGTGATTTTGATTATCCAGGATGTGCTATGGCTTACCAGGTAATTAATTAACTTGCTAATTTGTTTTATCCAGTTCAGAGTTCGAGTCCTAGGAATGAAGGA
SNP_position 1144
sequence_for_GGdesign CACAAGTCCTTAATGTTGCTTGTGGTGGCACACTTTATCAAGATTTAGAGAAAGAATTGT[A/C]CAAGAATCATCAAACCTCCGACNCTTNAGAAATGTTGTCATTGAAGAGCCAAAGCCAGAG
GGdesign_Final_Score 0.846
Ilmn_Id 10422_1144-0_B_R_1967851279
allele_1 A
allele_2 C

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_10 8.635

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain